تأسست هيئة الرقابة المالية في الثاني من يناير عام 1999، باعتبارها السلطة الإشرافية المتكاملة في كوريا بموجب قانون إنشاء المنظمات الإشرافية المالية ("قانون التأسيس") الذي وافقت عليه الجمعية الوطنية في التاسع والعشرين من ديسمبر عام 1997. أنشأ قانون التأسيس هيئة الرقابة المالية كسلطة إشرافية شبه حكومية مشرعة خصيصًا، وكلّفها بالإشراف المالي على القطاع المالي بأكمله.